MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis TL13

Total Repeats: 35277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021213	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142349
2	NC_021213	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	499142349
3	NC_021213	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	499142349
4	NC_021213	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	499142349
5	NC_021213	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
6	NC_021213	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499142349
7	NC_021213	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142349
8	NC_021213	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142349
9	NC_021213	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142349
10	NC_021213	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142349
11	NC_021213	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	499142349
12	NC_021213	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	499142349
13	NC_021213	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142349
14	NC_021213	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	499142349
15	NC_021213	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142349
16	NC_021213	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142349
17	NC_021213	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
18	NC_021213	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	499142349
19	NC_021213	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142349
20	NC_021213	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	499142349
21	NC_021213	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	499142349
22	NC_021213	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142349
23	NC_021213	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	499142349
24	NC_021213	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	499142349
25	NC_021213	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	499142349
26	NC_021213	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	499142349
27	NC_021213	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	499142349
28	NC_021213	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499142349
29	NC_021213	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142349
30	NC_021213	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	499142349
31	NC_021213	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
32	NC_021213	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	499142350
33	NC_021213	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	499142350
34	NC_021213	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142350
35	NC_021213	AACAAA	2	12	1826	1837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	499142350
36	NC_021213	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142350
37	NC_021213	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	499142350
38	NC_021213	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142350
39	NC_021213	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142350
40	NC_021213	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142350
41	NC_021213	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	499142350
42	NC_021213	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142350
43	NC_021213	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
44	NC_021213	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
45	NC_021213	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142350
46	NC_021213	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	499142350
47	NC_021213	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142350
48	NC_021213	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
49	NC_021213	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
50	NC_021213	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142350
51	NC_021213	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	499142350
52	NC_021213	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142350
53	NC_021213	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	499142350
54	NC_021213	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142350
55	NC_021213	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	499142351
56	NC_021213	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142351
57	NC_021213	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	499142351
58	NC_021213	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	499142351
59	NC_021213	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	499142351
60	NC_021213	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142351
61	NC_021213	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
62	NC_021213	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	499142351
63	NC_021213	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	499142351
64	NC_021213	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	499142351
65	NC_021213	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
66	NC_021213	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142351
67	NC_021213	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	499142351
68	NC_021213	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142351
69	NC_021213	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	499142351
70	NC_021213	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
71	NC_021213	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142351
72	NC_021213	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142351
73	NC_021213	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	499142351
74	NC_021213	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	499142351
75	NC_021213	GTAT	2	8	3645	3652	25 %	50 %	25 %	0 %	499142352
76	NC_021213	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142352
77	NC_021213	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142352
78	NC_021213	TGT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142352
79	NC_021213	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142352
80	NC_021213	CAG	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
81	NC_021213	TGG	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142354
82	NC_021213	TCA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142354
83	NC_021213	TGA	3	9	4717	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142354
84	NC_021213	TTG	2	6	4761	4766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142354
85	NC_021213	AG	3	6	4819	4824	50 %	0 %	50 %	0 %	499142354
86	NC_021213	CAA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142354
87	NC_021213	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	499142354
88	NC_021213	A	6	6	4908	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	499142354
89	NC_021213	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
90	NC_021213	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	499142354
91	NC_021213	ACC	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142354
92	NC_021213	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
93	NC_021213	GTG	3	9	5117	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142354
94	NC_021213	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	499142354
95	NC_021213	CAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142354
96	NC_021213	GTGC	2	8	5288	5295	0 %	25 %	50 %	25 %	499142354
97	NC_021213	TAT	2	6	5338	5343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142354
98	NC_021213	ATG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142354
99	NC_021213	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
100	NC_021213	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142354
101	NC_021213	CGT	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142354
102	NC_021213	CAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142354
103	NC_021213	A	6	6	5665	5670	100 %	0 %	0 %	0 %	499142355
104	NC_021213	ATC	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142355
105	NC_021213	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142355
106	NC_021213	A	6	6	5836	5841	100 %	0 %	0 %	0 %	499142355
107	NC_021213	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142355
108	NC_021213	TAG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142355
109	NC_021213	ATG	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142355
110	NC_021213	CAG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142355
111	NC_021213	TGTCT	2	10	6110	6119	0 %	60 %	20 %	20 %	499142355
112	NC_021213	AGA	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142355
113	NC_021213	AGA	3	9	6194	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142355
114	NC_021213	ATCA	2	8	6275	6282	50 %	25 %	0 %	25 %	499142356
115	NC_021213	AAT	2	6	6388	6393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142356
116	NC_021213	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142356
117	NC_021213	CTT	2	6	6475	6480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142356
118	NC_021213	GAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
119	NC_021213	TCAA	2	8	6532	6539	50 %	25 %	0 %	25 %	499142356
120	NC_021213	GCT	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142356
121	NC_021213	A	6	6	6722	6727	100 %	0 %	0 %	0 %	499142356
122	NC_021213	T	6	6	6821	6826	0 %	100 %	0 %	0 %	499142356
123	NC_021213	GAGAT	2	10	6828	6837	40 %	20 %	40 %	0 %	499142356
124	NC_021213	TC	3	6	6903	6908	0 %	50 %	0 %	50 %	499142356
125	NC_021213	TAG	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
126	NC_021213	CTTA	2	8	7005	7012	25 %	50 %	0 %	25 %	499142356
127	NC_021213	TTG	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
128	NC_021213	GAT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
129	NC_021213	TTG	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
130	NC_021213	GAT	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
131	NC_021213	CTT	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142356
132	NC_021213	CA	3	6	7351	7356	50 %	0 %	0 %	50 %	499142356
133	NC_021213	CCA	2	6	7378	7383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499142356
134	NC_021213	GTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142356
135	NC_021213	GCA	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142356
136	NC_021213	TAG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142356
137	NC_021213	GATG	2	8	7588	7595	25 %	25 %	50 %	0 %	499142356
138	NC_021213	TCA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142356
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264	NC_021213	A	6	6	13034	13039	100 %	0 %	0 %	0 %	499142361
265	NC_021213	TA	4	8	13060	13067	50 %	50 %	0 %	0 %	499142361
266	NC_021213	AGA	3	9	13125	13133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142362
267	NC_021213	GTT	2	6	13285	13290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142362
268	NC_021213	ATC	2	6	13372	13377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142362
269	NC_021213	ATT	2	6	13390	13395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142362
270	NC_021213	CTTTG	2	10	13431	13440	0 %	60 %	20 %	20 %	499142362
271	NC_021213	CTT	2	6	13471	13476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142362
272	NC_021213	GTT	2	6	13495	13500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142362
273	NC_021213	ATG	2	6	13568	13573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142362
274	NC_021213	TAT	2	6	13650	13655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142363
275	NC_021213	A	6	6	13683	13688	100 %	0 %	0 %	0 %	499142363
276	NC_021213	ATT	2	6	13699	13704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142363
277	NC_021213	ATT	2	6	13708	13713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142363
278	NC_021213	T	6	6	13738	13743	0 %	100 %	0 %	0 %	499142363
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282	NC_021213	TTC	2	6	14110	14115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142363
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286	NC_021213	TAAAGC	2	12	14172	14183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	499142363
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288	NC_021213	GTT	2	6	14260	14265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142363
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293	NC_021213	TTC	2	6	14398	14403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499142363
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296	NC_021213	GTTC	2	8	14458	14465	0 %	50 %	25 %	25 %	499142363
297	NC_021213	ATT	2	6	14466	14471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499142363
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301	NC_021213	GTCG	2	8	14527	14534	0 %	25 %	50 %	25 %	499142363
302	NC_021213	GTG	2	6	14540	14545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499142363
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338	NC_021213	ATTA	2	8	16352	16359	50 %	50 %	0 %	0 %	499142364
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354	NC_021213	TGT	2	6	23954	23959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142365
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374	NC_021213	A	7	7	24886	24892	100 %	0 %	0 %	0 %	499142367
375	NC_021213	TCTA	2	8	24924	24931	25 %	50 %	0 %	25 %	499142367
376	NC_021213	ATG	2	6	24962	24967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499142367
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379	NC_021213	CAA	2	6	25018	25023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
380	NC_021213	CAA	3	9	25033	25041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
381	NC_021213	AGA	2	6	25098	25103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
382	NC_021213	GGC	2	6	25137	25142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499142367
383	NC_021213	AATC	2	8	25262	25269	50 %	25 %	0 %	25 %	499142367
384	NC_021213	AATGC	2	10	25291	25300	40 %	20 %	20 %	20 %	499142367
385	NC_021213	TAA	2	6	25317	25322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499142367
386	NC_021213	AAC	2	6	25334	25339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499142367
387	NC_021213	TTG	2	6	25361	25366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499142367
388	NC_021213	ACT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
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390	NC_021213	CTG	2	6	25505	25510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499142367
391	NC_021213	AGA	2	6	25551	25556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499142367
392	NC_021213	AGC	2	6	25557	25562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499142367
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394	NC_021213	CAT	2	6	25751	25756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499142367
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